Desarrollo de oligonucleótidos para la detección de mutaciones moleculares relacionadas con la resistencia a herbicidas en avena silvestre (Avena fatua L.)
Tovar Hernández, Homero.
Desarrollo de oligonucleótidos para la detección de mutaciones moleculares relacionadas con la resistencia a herbicidas en avena silvestre (Avena fatua L.) [recurso electrónico] / Homero Tovar Hernández ; dir de tesis, Manuel Cruz Villegas. - Mexicali, Baja California, 2008. - 1 recurso en línea, il. col.
Maestría en Ciencias Agrícolas.
Tesis (Maestría) -- Universidad Autónoma de Baja California. Instituto de Ciencias Agrícolas, Mexicali, 2008.
Incluye referencias bibliográficas.
Se sintetizaron dos grupos de oligonucleótidos diseñados para la detección de dos mutaciones puntuales en el gen de la acetil-CoA carboxilasa (ACCasa) de avena silvestre (Avena fatua L.), las cuales están relacionadas con la resistencia a herbicidas que inhiben la síntesis de ácidos grasos. Se utilizaron cuatro poblaciones de avena silvestre (M5r, M25s, M28r y M43s), de las cuales dos (M5r y M28r) mostraron resistencia a la aplicación en campo de clodinafop propargil. Los oligonucleótidos se diseñaron en base a la secuencia del gen de la ACCasa de la avena silvestre (No. de acceso en GeneBank AF231334). El grupo 1 estuvo conformado por los oligonucleótidos VSE11GM, VRE11RGM, ACVII11GM y ACVII11RGM, diseñados para detectar el cambio de timina (T) por adenina (A) en posición 1,322 del gen descrito y originando el cambio de isoleucina (ATT) por asparagina (AAT) en la estructura molecular de la ACCasa de la avena silvestre. El segundo grupo estuvo conformado por los oligonucleótidos VRDICGM, VRDITRGM, ACVRG1GM y ACVRG1RGM, diseñados para detectar el cambio de timina (T) ó citosina (C) por adenina (A) en posición 541 del mismo gen y originando el cambio de isoleucina (ATA) por leucina (CTA ó TTA) en la estructura molecular de la ACCasa de avena silvestre. Se logró la amplificación con el primer grupo de oligonucleótidos de un fragmento de 480 pb para la población M28r, que indica la sustitución de isoleucina por asparagina, lo cual está relacionado con la presencia de resistencia a herbicidas del grupo de los aryloxyphenoxypropionatos (APPþs). Con el segundo grupo de oligonucleótidos no se logró, después de varias pruebas utilizando variaciones de la concentración y sustitución de los componentes de la PCR, la amplificación de los fragmentos de 496 pb y de 330 pb en ninguna de las cuatro poblaciones de la avena silvestre lo que indica ausencia de las mutaciones. La ausencia de la amplificación de un fragmento de 480 pb para la población resistente M5r, así como la ausencia de la amplificación de los fragmentos de 496 pb y 330 pb en las cuatro poblaciones, indica la posibilidad de que sea una mutación diferente la que le confiere resistencia a la avena silvestre hacia este grupo de herbicidas ó que sea un mecanismo de resistencia diferente lo que le confiere esta propiedad. Por lo tanto, será necesario conocer el número y la posición de todas las sustituciones de bases que generan cambios en la estructura molecular de la ACCasa de poblaciones de avena silvestre, que han mostrado resistencia en campo, para el diseño de oligonucleótidos que permitan iferenciarlas eficientemente dentr
Avena loca--Control--Tesis y disertaciones académicas.
Avena silvestre--Control--Tesis y disertaciones académicas.
SB191.W53 / T68 2008
Desarrollo de oligonucleótidos para la detección de mutaciones moleculares relacionadas con la resistencia a herbicidas en avena silvestre (Avena fatua L.) [recurso electrónico] / Homero Tovar Hernández ; dir de tesis, Manuel Cruz Villegas. - Mexicali, Baja California, 2008. - 1 recurso en línea, il. col.
Maestría en Ciencias Agrícolas.
Tesis (Maestría) -- Universidad Autónoma de Baja California. Instituto de Ciencias Agrícolas, Mexicali, 2008.
Incluye referencias bibliográficas.
Se sintetizaron dos grupos de oligonucleótidos diseñados para la detección de dos mutaciones puntuales en el gen de la acetil-CoA carboxilasa (ACCasa) de avena silvestre (Avena fatua L.), las cuales están relacionadas con la resistencia a herbicidas que inhiben la síntesis de ácidos grasos. Se utilizaron cuatro poblaciones de avena silvestre (M5r, M25s, M28r y M43s), de las cuales dos (M5r y M28r) mostraron resistencia a la aplicación en campo de clodinafop propargil. Los oligonucleótidos se diseñaron en base a la secuencia del gen de la ACCasa de la avena silvestre (No. de acceso en GeneBank AF231334). El grupo 1 estuvo conformado por los oligonucleótidos VSE11GM, VRE11RGM, ACVII11GM y ACVII11RGM, diseñados para detectar el cambio de timina (T) por adenina (A) en posición 1,322 del gen descrito y originando el cambio de isoleucina (ATT) por asparagina (AAT) en la estructura molecular de la ACCasa de la avena silvestre. El segundo grupo estuvo conformado por los oligonucleótidos VRDICGM, VRDITRGM, ACVRG1GM y ACVRG1RGM, diseñados para detectar el cambio de timina (T) ó citosina (C) por adenina (A) en posición 541 del mismo gen y originando el cambio de isoleucina (ATA) por leucina (CTA ó TTA) en la estructura molecular de la ACCasa de avena silvestre. Se logró la amplificación con el primer grupo de oligonucleótidos de un fragmento de 480 pb para la población M28r, que indica la sustitución de isoleucina por asparagina, lo cual está relacionado con la presencia de resistencia a herbicidas del grupo de los aryloxyphenoxypropionatos (APPþs). Con el segundo grupo de oligonucleótidos no se logró, después de varias pruebas utilizando variaciones de la concentración y sustitución de los componentes de la PCR, la amplificación de los fragmentos de 496 pb y de 330 pb en ninguna de las cuatro poblaciones de la avena silvestre lo que indica ausencia de las mutaciones. La ausencia de la amplificación de un fragmento de 480 pb para la población resistente M5r, así como la ausencia de la amplificación de los fragmentos de 496 pb y 330 pb en las cuatro poblaciones, indica la posibilidad de que sea una mutación diferente la que le confiere resistencia a la avena silvestre hacia este grupo de herbicidas ó que sea un mecanismo de resistencia diferente lo que le confiere esta propiedad. Por lo tanto, será necesario conocer el número y la posición de todas las sustituciones de bases que generan cambios en la estructura molecular de la ACCasa de poblaciones de avena silvestre, que han mostrado resistencia en campo, para el diseño de oligonucleótidos que permitan iferenciarlas eficientemente dentr
Avena loca--Control--Tesis y disertaciones académicas.
Avena silvestre--Control--Tesis y disertaciones académicas.
SB191.W53 / T68 2008
