Implementación de un modelo estadístico para la estimación de valores genómicos de crianza de ganado bovino, utilizando marcadores SNP
Angulo Cuevas, Nataniel.
Implementación de un modelo estadístico para la estimación de valores genómicos de crianza de ganado bovino, utilizando marcadores SNP [recurso electrónico] / Nataniel Angulo Cuevas ; directores, Rafael Villa Angulo, Victor Manuel González Vizcarra. - Mexicali, Baja California, 2015. - 1 recurso en línea (64 p. : il. col., gráficas)
Maestría y Doctorado en Ciencias e Ingeniería.
Tesis (Maestría) --Universidad Autónoma de Baja California.
Incluye referencias bibliográficas.
La Estimación de los Valores de Crianza tradicional combina solo datos fenotípicos y de pedigrí, hoy en día, con la inclusión de marcadores moleculares, tales como los SNPs (Single Nucleotid Polimorfims, por sus siglas en ingles), en la integración del análisis genético en los esquemas de selección, ya es posible integrar datos genotípicos para realizar estas estimaciones. Avances en las tecnologías de genotipificación de salida masiva para bovinos llevaron al desarrollo de los SNPchips, de los cuales hay de diferentes capacidades. Para la Estimación de los Valores Genómicos de Crianza (GEBV, por sus siglas en ingles) existen diferentes métodos basados en el contexto del Modelo Lineal de Mezclas (Linear Mixed Models), en los que encontramos el GBLUP (Genomic Best Linear Unbiased Prediction) el cual es un método que utiliza relaciones genómicas para realizar dichas estimaciones. Para esto, es usada una matriz de relaciones genómicas, estimada de marcadores moleculares (como SNPs). Esta matriz define la covarianza entre individuos en un grupo de estudio basada en similitud observada a nivel genómico, en vez de la similitud basada en pedigrí. En este trabajo de tesis se reporta la implementación y pruebas de una herramienta bioinformática que implementa el GBLUP para estimar los valores genómicos de ganado bovino. Esta herramienta es parte integral del primer sistema tecnológico para la implementación de un programa de mejora genética basado en Selección Genómica, en el Estado de Baja Californias.
Ganado vacuno--Reproducción--Tesis y disertaciones académicas.
Genómica--Investigaciones--Tesis y disertaciones académicas.
SF201 / A53 2015
Implementación de un modelo estadístico para la estimación de valores genómicos de crianza de ganado bovino, utilizando marcadores SNP [recurso electrónico] / Nataniel Angulo Cuevas ; directores, Rafael Villa Angulo, Victor Manuel González Vizcarra. - Mexicali, Baja California, 2015. - 1 recurso en línea (64 p. : il. col., gráficas)
Maestría y Doctorado en Ciencias e Ingeniería.
Tesis (Maestría) --Universidad Autónoma de Baja California.
Incluye referencias bibliográficas.
La Estimación de los Valores de Crianza tradicional combina solo datos fenotípicos y de pedigrí, hoy en día, con la inclusión de marcadores moleculares, tales como los SNPs (Single Nucleotid Polimorfims, por sus siglas en ingles), en la integración del análisis genético en los esquemas de selección, ya es posible integrar datos genotípicos para realizar estas estimaciones. Avances en las tecnologías de genotipificación de salida masiva para bovinos llevaron al desarrollo de los SNPchips, de los cuales hay de diferentes capacidades. Para la Estimación de los Valores Genómicos de Crianza (GEBV, por sus siglas en ingles) existen diferentes métodos basados en el contexto del Modelo Lineal de Mezclas (Linear Mixed Models), en los que encontramos el GBLUP (Genomic Best Linear Unbiased Prediction) el cual es un método que utiliza relaciones genómicas para realizar dichas estimaciones. Para esto, es usada una matriz de relaciones genómicas, estimada de marcadores moleculares (como SNPs). Esta matriz define la covarianza entre individuos en un grupo de estudio basada en similitud observada a nivel genómico, en vez de la similitud basada en pedigrí. En este trabajo de tesis se reporta la implementación y pruebas de una herramienta bioinformática que implementa el GBLUP para estimar los valores genómicos de ganado bovino. Esta herramienta es parte integral del primer sistema tecnológico para la implementación de un programa de mejora genética basado en Selección Genómica, en el Estado de Baja Californias.
Ganado vacuno--Reproducción--Tesis y disertaciones académicas.
Genómica--Investigaciones--Tesis y disertaciones académicas.
SF201 / A53 2015
