Herramienta bioinformática para la estimación de parámetros genéticos de poblaciones, utilizando marcadores SNP [recurso electrónico] /
Soto Sigala, Kathleen Stephany
Herramienta bioinformática para la estimación de parámetros genéticos de poblaciones, utilizando marcadores SNP [recurso electrónico] / Kathleen Stephany Soto Sigala ; director, Rafael Villa Angulo - Mexicali, Baja california : 2019. - 1 recurso en linea, 67 p. il. col.
Maestría y Doctorado en Ciencias e Ingeniería
Tesis (Maestría) - Universidad Autónoma de Baja California, Instituto de Ingeniería, Mexicali, 2019.
Incluye referencias bibliográficas.
En Proyecto de tesis de maestría se desarrolló de una herramienta bioinformática, con un
ambiente gráfico amigable, que implementa algoritmos para realizar estimación de
Frecuencias alélicas, Heterocigosidad y Consanguinidad, partiendo de información de
marcadores tipo SNP, de una población de individuos. En el este documento se presentan
las etapas desarrolladas para el cumplimiento del objetivo general. Primero se presenta un
estudio previo sobre conceptos básico de genética y genética de poblaciones,
posteriormente se presenta el diseño de la herramienta bioinformática, incluyendo el
código en el lenguaje de programación Python de los algoritmos para estimar frecuencias
alélicas, heterocigosidad y consanguinidad. Igualmente se presenta un ejemplo de la
interfaz gráfica desarrollada, y resultados obtenidos al probar la herramienta con datos de
genotipos reales.
En conclusión, este trabajo presenta los primeros pasos para la generación de una
herramienta bioinformática que englobará estimaciones de parámetros genéticos basada
en marcadores SNP. En especial se consideraron la estimación de parámetros de
Frecuencias alélicas, Heterocigosidad y consanguinidad.
Como trabajo futuro se plantea obtener una representación gráfica de los datos, de una
forma mas amigable para el usuario, y que integres el análisis de otros parámetros
genéticos, tales como Desequilibrio por ligamento, pruebas de asociación, estimación de
Valores Genomicos, entre otros.
Polimorfismo de nucleótido simple--Procesamiento de datos--Tesis y disertaciones académicas.
Genética--Procesamiento de datos--Tesis y disertaciones académicas.
Bioinformática--Tesis y disertaciones académicas.
QH447.63 .S56 / S68 2019
Herramienta bioinformática para la estimación de parámetros genéticos de poblaciones, utilizando marcadores SNP [recurso electrónico] / Kathleen Stephany Soto Sigala ; director, Rafael Villa Angulo - Mexicali, Baja california : 2019. - 1 recurso en linea, 67 p. il. col.
Maestría y Doctorado en Ciencias e Ingeniería
Tesis (Maestría) - Universidad Autónoma de Baja California, Instituto de Ingeniería, Mexicali, 2019.
Incluye referencias bibliográficas.
En Proyecto de tesis de maestría se desarrolló de una herramienta bioinformática, con un
ambiente gráfico amigable, que implementa algoritmos para realizar estimación de
Frecuencias alélicas, Heterocigosidad y Consanguinidad, partiendo de información de
marcadores tipo SNP, de una población de individuos. En el este documento se presentan
las etapas desarrolladas para el cumplimiento del objetivo general. Primero se presenta un
estudio previo sobre conceptos básico de genética y genética de poblaciones,
posteriormente se presenta el diseño de la herramienta bioinformática, incluyendo el
código en el lenguaje de programación Python de los algoritmos para estimar frecuencias
alélicas, heterocigosidad y consanguinidad. Igualmente se presenta un ejemplo de la
interfaz gráfica desarrollada, y resultados obtenidos al probar la herramienta con datos de
genotipos reales.
En conclusión, este trabajo presenta los primeros pasos para la generación de una
herramienta bioinformática que englobará estimaciones de parámetros genéticos basada
en marcadores SNP. En especial se consideraron la estimación de parámetros de
Frecuencias alélicas, Heterocigosidad y consanguinidad.
Como trabajo futuro se plantea obtener una representación gráfica de los datos, de una
forma mas amigable para el usuario, y que integres el análisis de otros parámetros
genéticos, tales como Desequilibrio por ligamento, pruebas de asociación, estimación de
Valores Genomicos, entre otros.
Polimorfismo de nucleótido simple--Procesamiento de datos--Tesis y disertaciones académicas.
Genética--Procesamiento de datos--Tesis y disertaciones académicas.
Bioinformática--Tesis y disertaciones académicas.
QH447.63 .S56 / S68 2019
