Herramienta bioinformática para la estimación de parámetros genéticos de poblaciones, utilizando marcadores SNP [recurso electrónico] / Kathleen Stephany Soto Sigala ; director, Rafael Villa Angulo

Por: Soto Sigala, Kathleen StephanyColaborador(es): Villa Angulo, Rafael [dir.] | Universidad Autónoma de Baja California. Instituto de IngenieríaTipo de material: TextoTextoDetalles de publicación: Mexicali, Baja california : 2019Descripción: 1 recurso en linea, 67 p. il. colTema(s): Polimorfismo de nucleótido simple -- Procesamiento de datos -- Tesis y disertaciones académicas | Genética -- Procesamiento de datos -- Tesis y disertaciones académicas | Bioinformática -- Tesis y disertaciones académicasClasificación LoC:QH447.63 .S56 | S68 2019Recursos en línea: Tesis digitalTexto Nota de disertación: Tesis (Maestría) - Universidad Autónoma de Baja California, Instituto de Ingeniería, Mexicali, 2019. Resumen: En Proyecto de tesis de maestría se desarrolló de una herramienta bioinformática, con un ambiente gráfico amigable, que implementa algoritmos para realizar estimación de Frecuencias alélicas, Heterocigosidad y Consanguinidad, partiendo de información de marcadores tipo SNP, de una población de individuos. En el este documento se presentan las etapas desarrolladas para el cumplimiento del objetivo general. Primero se presenta un estudio previo sobre conceptos básico de genética y genética de poblaciones, posteriormente se presenta el diseño de la herramienta bioinformática, incluyendo el código en el lenguaje de programación Python de los algoritmos para estimar frecuencias alélicas, heterocigosidad y consanguinidad. Igualmente se presenta un ejemplo de la interfaz gráfica desarrollada, y resultados obtenidos al probar la herramienta con datos de genotipos reales. En conclusión, este trabajo presenta los primeros pasos para la generación de una herramienta bioinformática que englobará estimaciones de parámetros genéticos basada en marcadores SNP. En especial se consideraron la estimación de parámetros de Frecuencias alélicas, Heterocigosidad y consanguinidad. Como trabajo futuro se plantea obtener una representación gráfica de los datos, de una forma mas amigable para el usuario, y que integres el análisis de otros parámetros genéticos, tales como Desequilibrio por ligamento, pruebas de asociación, estimación de Valores Genomicos, entre otros.
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Existencias
Tipo de ítem Biblioteca actual Colección Signatura Copia número Estado Fecha de vencimiento Código de barras
Tesis Biblioteca Central Mexicali
Colección de Tesis QH447.63 .S56 S68 2019 (Browse shelf(Abre debajo)) 1 Disponible MXL121840

Maestría y Doctorado en Ciencias e Ingeniería

Tesis (Maestría) - Universidad Autónoma de Baja California, Instituto de Ingeniería, Mexicali, 2019.

Incluye referencias bibliográficas.

En Proyecto de tesis de maestría se desarrolló de una herramienta bioinformática, con un
ambiente gráfico amigable, que implementa algoritmos para realizar estimación de
Frecuencias alélicas, Heterocigosidad y Consanguinidad, partiendo de información de
marcadores tipo SNP, de una población de individuos. En el este documento se presentan
las etapas desarrolladas para el cumplimiento del objetivo general. Primero se presenta un
estudio previo sobre conceptos básico de genética y genética de poblaciones,
posteriormente se presenta el diseño de la herramienta bioinformática, incluyendo el
código en el lenguaje de programación Python de los algoritmos para estimar frecuencias
alélicas, heterocigosidad y consanguinidad. Igualmente se presenta un ejemplo de la
interfaz gráfica desarrollada, y resultados obtenidos al probar la herramienta con datos de
genotipos reales.
En conclusión, este trabajo presenta los primeros pasos para la generación de una
herramienta bioinformática que englobará estimaciones de parámetros genéticos basada
en marcadores SNP. En especial se consideraron la estimación de parámetros de
Frecuencias alélicas, Heterocigosidad y consanguinidad.
Como trabajo futuro se plantea obtener una representación gráfica de los datos, de una
forma mas amigable para el usuario, y que integres el análisis de otros parámetros
genéticos, tales como Desequilibrio por ligamento, pruebas de asociación, estimación de
Valores Genomicos, entre otros.

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