MARC details
| 000 -LIDER |
|---|
| fixed length control field |
04006nam a22002777a 4500 |
| 003 - CONTROL NUMBER IDENTIFIER |
|---|
| control field |
MX-MeUAM |
| 005 - DATE AND TIME OF LATEST TRANSACTION |
|---|
| control field |
20201112112249.0 |
| 008 - FIXED-LENGTH DATA ELEMENTS--GENERAL INFORMATION |
|---|
| fixed length control field |
200930s2020 mx fo d spa d |
| 040 ## - CATALOGING SOURCE |
|---|
| Original cataloging agency |
MX-MeUAM |
| Language of cataloging |
spa |
| 050 #0 - LIBRARY OF CONGRESS CALL NUMBER |
|---|
| Classification number |
QH447.6 |
| Item number |
B42 2020 |
| 100 1# - MAIN ENTRY--PERSONAL NAME |
|---|
| Personal name |
Becerra Buenrostro, José Luis |
| 9 (RLIN) |
22140 |
| 245 10 - TITLE STATEMENT |
|---|
| Title |
Detección de señales de selección en ganado bovino utilizando marcadores SNP de alta densidad |
| Medium |
[recurso electrónico] / |
| Statement of responsibility, etc. |
José Luis Becerra Buenrostro ; director, Rafael Villa Angulo ; codirector, Ricardo Salomón Torres |
| 260 ## - PUBLICATION, DISTRIBUTION, ETC. (IMPRINT) |
|---|
| Place of publication, distribution, etc. |
Mexicali, Baja California, |
| Date of publication, distribution, etc. |
2020 |
| 300 ## - PHYSICAL DESCRIPTION |
|---|
| Extent |
Recurso en línea, 106 p. : |
| Other physical details |
il. col. |
| 500 ## - GENERAL NOTE |
|---|
| General note |
Maestría en Ciencias |
| 502 ## - DISSERTATION NOTE |
|---|
| Dissertation note |
Tesis (Maestría ) -- Universidad Autónoma de Baja California. Instituto de Ingeniería, Mexicali, 2020 |
| 520 ## - SUMMARY, ETC. |
|---|
| Summary, etc. |
Las señales de selección (SS) son definidas como regiones en el genoma que albergan variaciones<br/>funcionales importantes en secuencias de ADN y que han estado sujetas, ya sea a presión natural<br/>o artificial, dejando un patrón especial en dichas regiones. Existen diversos métodos para detectar<br/>SS, entre ellos los basados en la Homocigosidad Haplotípica Extendida, EHH (Extended<br/>Haplotype Homozygosity por sus siglas en inglés) definida como la probabilidad de que dos<br/>cromosomas elegidos al azar que portan el mismo alelo en un SNP particular (SNP focal), sean<br/>idénticos por descendencia para todo un intervalo (bloque), desde el SNP focal a una distancia<br/>dada en torno a él. Una extensión de EHH es el estadístico iHS (Integrated Haplotype Score, por<br/>sus siglas en inglés), que compara EHH entre los alelos ancestrales y derivados en una población.<br/>El objetivo de este trabajo de tesis fue detectar la presencia de señales de selección positiva en 19<br/>linajes bovinos, mediante el análisis de iHS en haplotipos de alta densidad. La información<br/>genética provenía de 507 especímenes de ganado bovino cuyos linajes pertenecen a las<br/>subespecies: Bos taurus y Bos indicus.<br/>Después de aplicar los filtros de calidad, el número promedio de marcadores retenidos por<br/>cromosoma fue de 546,961 SNPs, lo que equivale al 73.62 % de los SNPs autosomales<br/>comprendidos en el BovineHD Genotyping BeadChip.<br/>Para el cálculo de iHS se utilizó la paquetería rehh en el entorno de programación R, se<br/>promediaron los valores absolutos de iHS a lo largo de todo el genoma en regiones sin traslape de<br/>500 Kb de longitud (|iHS|). Se generaron gráficas de Manhattan para observar la distribución de<br/>los valores de |iHS| estandarizados y se establecieron como regiones significativas aquellas que<br/>superaron el valor extremo 2.33, que representa un intervalo de confidencia del 98 % (α=0.02). El<br/><br/>IX<br/>análisis reveló señales de selección positiva de intensidad variable en las 19 razas, con un valor<br/>promedio de regiones significativas por raza de 51, lo que corresponde al 1%.<br/>Se analizaron las 5 regiones más significativas para inspeccionar la presencia de elementos<br/>anotados utilizando la base de datos btaurus_gene_ensembl (BioMart) y la base de datos<br/>AnimalQTLdb para rasgos de producción asociados. Numerosos elementos genéticos como genes,<br/>pseudogenes, transcritos de RNA y QTL fueron detectados, mayormente vinculados a procesos de<br/>producción, reproducción, metabolismo y sistema inmune, algunos de los cuales han sido<br/>reportados es estudios previos. |
| 650 #7 - SUBJECT ADDED ENTRY--TOPICAL TERM |
|---|
| Término temático o nombre geográfico como elemento de entrada |
Polimorfismos de un solo nucleótido |
| Fuente del encabezamiento o término |
lemb |
| Subdivisión de forma |
Tesis y disertaciones académicas. |
| Subdivisión general |
Manuales de laboratorio |
| 650 #7 - SUBJECT ADDED ENTRY--TOPICAL TERM |
|---|
| Término temático o nombre geográfico como elemento de entrada |
Ganado vacuno |
| Fuente del encabezamiento o término |
lemb |
| Subdivisión de forma |
Tesis y disertaciones académicas. |
| 650 #7 - SUBJECT ADDED ENTRY--TOPICAL TERM |
|---|
| Término temático o nombre geográfico como elemento de entrada |
Polimorfismos genéticos |
| Fuente del encabezamiento o término |
lemb |
| Subdivisión de forma |
Tesis y disertaciones académicas. |
| 700 1# - ADDED ENTRY--PERSONAL NAME |
|---|
| Personal name |
Villa Angulo, Rafael |
| 9 (RLIN) |
2041 |
| Relator term |
dir. |
| 700 1# - ADDED ENTRY--PERSONAL NAME |
|---|
| Personal name |
Salomón Torres, Ricardo |
| 9 (RLIN) |
5311 |
| Relator term |
codir. |
| 710 2# - ADDED ENTRY--CORPORATE NAME |
|---|
| 9 (RLIN) |
3321 |
| Corporate name or jurisdiction name as entry element |
Universidad Autónoma de Baja California. |
| Subordinate unit |
Instituto de Ingeniería |
| 856 4# - ELECTRONIC LOCATION AND ACCESS |
|---|
| Uniform Resource Identifier |
https://drive.google.com/file/d/1A_7wwmRxpSH3urkAl376RXx0H5KXOv_2/view?usp=sharing |
| Public note |
Tesis Digital. |
| 942 ## - ADDED ENTRY ELEMENTS (KOHA) |
|---|
| Koha item type |
Tesis |
